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大腸桿菌轉(zhuǎn)化子有大有小原因分析
點(diǎn)擊次數(shù):824 更新時(shí)間:2020-01-09

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      這情況我遇到過(guò),尤其菌液PCR時(shí)候,有的強(qiáng)有的弱,有的帶大小還不一樣。我沒(méi)有具體研究過(guò)啥愿意,但把大小一樣的那個(gè)送去測(cè)序,一般都是正確的。


關(guān)于你的這個(gè)情況,我分析【我自己的我也分析過(guò)】
1、可能酶產(chǎn)物碎了一些,這樣連進(jìn)去就有大有小。如果你引物用的是在載體上的,那很可能擴(kuò)出大小不同的。如果你引物就是在基因上的,這個(gè)好解決,你把退火溫度逐漸提高,看看是不是那個(gè)不同片段就沒(méi)了。
2、有的時(shí)候發(fā)生了片段自連【這個(gè)看起來(lái)好像很可笑,但其實(shí)我發(fā)現(xiàn)只要末端有一個(gè)堿基配對(duì),時(shí)間長(zhǎng)的話,片段是可以連接到一起的,這個(gè)就跟TA連接實(shí)際一樣】。
3、你的電泳系統(tǒng)有污染,你把別人的片段給收進(jìn)去了,這個(gè)我確實(shí)證實(shí)過(guò),我一批克隆40個(gè)基因,我曾經(jīng)在別的克隆中挑出過(guò)另外的基因。
4、另一種可能,你T載體上連接的方向問(wèn)題,如果酶切不*,可能同樣會(huì)造成不同大小片段,這些如果你量很多的話其實(shí)在跑電泳回收時(shí)候是分不開(kāi)的,但PCR趕巧了,也許就正好擴(kuò)出來(lái)了【這種情況只限于載體上有你用的酶切位點(diǎn),而你目的片段上恰恰引入了這連個(gè)酶,這個(gè)你可以試著畫(huà)個(gè)圖看看,把TA連接的正反畫(huà)畫(huà)】。
5、DH好像能長(zhǎng)很大的,也沒(méi)關(guān)系的,我的有時(shí)候就很大點(diǎn),其實(shí)不用放室溫,你冰箱4-8℃那層放置1個(gè)月,就看出來(lái)了。
6、所以我覺(jué)得這個(gè)問(wèn)題也沒(méi)法糾結(jié)了。如果你覺(jué)得切割實(shí)在很難,那干脆重新PCR從T載體上擴(kuò)出來(lái)【高保真擴(kuò)一般也不會(huì)突變,當(dāng)然TAKARA的primerstar除外】,帶上酶切位點(diǎn),然后直接回收酶切連接就可以了,找到重組子后測(cè)序正確在表達(dá)就行了不是。

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